תנועת חב"ד מביעה צער עמוק על הסתלקותו של אחד מענקי הדור, שכל מעייניו בלימוד תורה ובהפצתה להמוני העם, שהחזיר את עטרת יהדות ספרד ליושנה, ופעל גדולות ונצורות לקירוב ליבם של ישראל לאביהם שבשמים.
הרב עובדיה יוסף היה ידיד אמת לחסידות חב"ד ולמפעליה, והתבטא בהערכה עצומה על פועלו של הרבי מליובאוויטש, במילים: "יחיד בדור בהרבצת התורה בישראל. לא קם כמוהו". הרב תרם תרומה חשובה מאוד לשיתוף פעולה מבורך בין שומעי לקחו ובין חסידי חב"ד, דבר שחיזק את אחדות העם ואת חיזוק התורה והפצתה.
יחד עם המוני בית ישראל מביעה תנועת חב"ד את השתתפותה באבל הכבד, ושולחת תנחומים למשפחתו של הרב ולכל תלמידיו וההולכים בדרכיו.
ייתן ה' שאורו הגדול של הרב יוסיף להאיר את הדרך, ובהמשך פיתוח מפעליו הכבירים והפצת תורתו תמצאו ניחומים, עד ביאת משיח צדקנו במהרה בימינו, כאשר יקויים הייעוד "הקיצו ורננו שוכני עפר".
במשך ימי ה״שבעה״ ילמדו בבית חב״ד פארק המדע ובבית הכנסת ״אפריקה ישראל״ (ומומלץ גם בשאר המנינים בפארק) לאחר תפילת מנחה משניות לעילוי נשמתו.